POSCAR的基本结构
以乙醇为例,一个典型的POSCAR文件结构如下:
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17
| EtOH 1.0 20.0 0.0 0.0 0.0 20.0 0.0 0.0 0.0 20.0 O C H 1 2 6 Cartesian -2.38139474 1.35341740 1.25871302 -4.32473454 0.62974202 0.00000000 -3.81139232 1.35569830 1.25740497 -3.96808011 -0.37906798 0.00000000 -3.96806170 1.13414021 -0.87365150 -5.39473454 0.62975521 0.00000000 -4.16644866 2.36507139 1.25642745 -4.16966143 0.85242986 2.12105486 -2.06093475 1.80589430 2.04240305
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※ 第1行:POSCAR文件的标题,可随意取,但不可以没有;
※ 第2行:缩放系数,此处取1.0,倘若使用其他值,后续的坐标需要相应地除以缩放系数;
※ 第3-5行:计算体系的范围(晶格向量),三行分别为三个基向量的坐标;
※ 第6行: 体系中含有的元素(元素符号):
▪ 第一个元素符号顶格写,元素符号之间用空格分隔;
▪ 如果计算的文件夹中已经有与结构一致的POTCAR,则这一行在POSCAR中可以不需要;
※ 第7行:与上一行元素相对应的原子数目;
※ 第8行: 体系中原子的坐标系,可以选择笛卡尔坐标或是分数坐标系:
▪ C或c代表笛卡尔坐标系,D或d代表分数坐标系;
▪ 输出文件CONTCAR中采用的是分数坐标系;
※ 第9-N行:体系中原子的坐标信息。